Испания, 1944 год. В густых лесах Наварры партизаны ведут отчаянную борьбу против фашистского режима. Десятилетняя Офелия, мечтательная и одинокая девочка, прибывает с беременной матерью Кармен в военный лагерь к своему новому отчиму — капитану Видалю. Жестокий офицер армии Франко, он безжалостно преследует повстанцев, стремясь очистить регион любыми средствами.
Однажды Офелия находит рядом с домом древний заброшенный лабиринт. Ведомая таинственной феей, она проникает в его сердце, где встречает Фавна — хранителя подземного мира. Существо открывает ей невероятную тайну: Офелия — пропавшая принцесса волшебного королевства, которую ищут уже много столетий. Чтобы вернуться домой, ей предстоит выполнить три испытания до полнолуния, храня свою миссию в строжайшей тайне.